1998年，常州港获省政府批准为二类开放口岸，2003年通过一类开放口岸国家验收。2008年，常州港录安洲港区码头对外开放，年吞吐量260万吨，2015年，录安洲码头4号泊位建成运行，成为常州港首个可以停泊10万吨级以下货轮的码头。目前，常州港由录安洲港区、圩塘港区和夹江港区构成的“一港三区”的总体发展格局。

2019年，常州综合港务区在常州综合保税区正式挂牌。综合港务区涵盖常州市新北区范围的奔牛国际机场空港、长江常州港、大运河奔牛港与铁路奔牛货场、常州综合保税区“三港一区”， 总面积约48.8平方公里。综合港务区发挥常州交通中轴优势，建成长三角物流汇聚地、长三角现代物流中心“桥头堡”。

常州港拥有口岸线8.5公里，泊位28个（万吨级以上10个），通过能力超3000万吨。2021年，常州港口岸完成货物运输量5202万吨，其中对外贸易货运量1206万吨；集装箱运量35.5万标箱，其中对外贸易集装箱运量9.9万标箱；到港国际航行船舶1585艘次。

内河奔牛港拥有7条铁路专用线，总长10公里，可实现水铁联运的无缝衔接。常州海铁联运业务分别从常州火车东站和奔牛港出发，至上海芦潮港的国际货运集装箱海铁联运班列，2019年开始运行。

常州空港为4E级机场，2021年，年货邮吞吐量1.9万吨，同比增长6.37%。成功引进跨境速运全货机，实现全市及周边地区“跨省6小时”速达。

常州综合保税区是国内功能最全面的海关特殊监管区域。2016年，长三角跨境电商枢纽常州跨境电商产业园在综保区内成立。截至2021年，跨境电商产业园累计吸引30余家企业入驻，进出口清单达227万票，金额2.2亿元，位列全省第二。